Rajungan hidup pada habitat beraneka ragam, yakni perairan pantai dengan dasar pasir berlumpur dan laut terbuka. daerah penyebarannya dapat mencapai kedalaman perairan hingga 70 m.
Salah satu aspek penting dalam budidaya perairan/perikanan, termasuk budi daya kepiting bakau adalah ketersedian benih, baik kuantitas( jumlah ), kualitas ( mutu ), dan kontinuitas ( secara terus menerus ). benih kepiting bakau dapat diperoleh dari alam (ditangkap), di balai benih hatchery atau dilakukan pembenihan sendiri.